مجلس ادارة الهيئة هو السلطة العليا التي تتولى شؤونها وادارة امورها ووضع السياسة العامة التي تسير عليها، وله بصفة خاصة الاختصاصات الاتية: 1 - اقتراح مشروعات الانظمة المتعلقة بعمل الهيئة وعلاقاتها بغيرها ورفع ذلك بحسب الاجراءات النظامية. 2 - اعداد اللائحة التنفيذية لهذا النظام. 3 - اعتماد اللوائح المالية والادارية للهيئة. 4 - تكوين اللجان ومنحها الصلاحيات اللازمة بهدف انجاز المسائل التي تعرض عليها على ان تشترك وزارة الشؤون الاجتماعية في اي لجنة لها علاقة باختصاص الوزارة. 5 - تفويض بعض صلاحياته لمن يرى من منسوبي الهيئة في حدود القواعد التي يضعها. 6 - المحافظة على اموال المشمولين بهذا النظام الموجودة خارج البلاد وبيان كيفية ادارتها وما يلزم لذلك. 7 - تنظيم طرق ووسائل استثمار وادارة اموال المشمولين بهذا النظام. 8 - انشاء فروع ومكاتب للهيئة لتحقيق اغراضها. 9 - الموافقة على التقرير السنوي والحساب الختامي للهيئة ورفعهما الى رئيس مجلس الوزراء حسب النظام. 10 - اعتماد مشروع ميزانية الهيئة والتقديرات المالية السنوية لايرادات الهيئة ومصروفاتها المشمولة بهذا النظام. 11 - تخصيص نسبة لا تتجاوز (5 %) من صافي عائد استثمار الاموال التي تديرها الهيئة لما يعود بالنفع العام على جميع الاغراض التي انشئت من اجلها وتغطية جزء من مصروفاتها. 12 - اعتماد الحسابات السنوية لايرادات ومصروفات الاوقاف المشمولة بهذا النظام.